lipase/doc/notes/2019-07-09-meeting.md

Réunion d'avancement du 09/07/2019
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Présents
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- Véronique Vié
- Guillaume Raffy

Compte-rendu
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plan
1. ouvrir les images
2. adapter les prétraitements de Marie-Françoise matlab  en jython
3. mesure de la diminution des globules au cours du temps
	1. suppression des pièges (masques + tracking)
    2. detection des particules : 1 cinétique par particule
		- idée pour la séparation des particules : suivi de contour et detection de portions circulaires pour en déduire les particules en supposoant que'elles sont sphériques.
4. présenter les résultats 
	1. tableau 7 colonnes
		- numéro de particule
		- temps
		- sphéricité
		- rayon
		- position centre
- estimateWhiteFluoImageTelemos
	- entrée : S: 1 sequence fluo
	- sortie : E: 1 image de white fluo estimée
- findWhiteReferenceImageTelemos : trouve le meilleur z dans un stack de white (matériau fluorescent : lame de Matthieu)
	- entree :
		- E : 1 image de white fluo estimée
		- W : 1 stack de white (référence)
		- darkImage 
	 -sortie 
	 	- R : 1 image de white de reference après soustraction du Dark