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lipase/doc/notes/2019-07-09-meeting.md

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Réunion d'avancement du 09/07/2019

Présents

  • Véronique Vié
  • Guillaume Raffy

Compte-rendu

plan 1. ouvrir les images 2. adapter les prétraitements de Marie-Françoise matlab en jython 3. mesure de la diminution des globules au cours du temps 3.1 suppression des pièges (masques + tracking) 3.2 detection des particules : 1 cinétique par particule - idée pour la séparation des particules : suivi de contour et detection de portions circulaires pour en déduire les particules en supposoant que'elles sont sphériques. 4. présenter les résultats 4.1 tableau 7 colonnes - numéro de particule - temps - sphéricité - rayon - position centre

  • estimateWhiteFluoImageTelemos
    • entrée : S: 1 sequence fluo
    • sortie : E: 1 image de white fluo estimée
  • findWhiteReferenceImageTelemos : trouve le meilleur z dans un stack de white (matériau fluorescent : lame de Matthieu)
    • entree :
      • E : 1 image de white fluo estimée
      • W : 1 stack de white (référence)
      • darkImage -sortie
      • R : 1 image de white de reference après soustraction du Dark