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Réunion d'avancement du 09/07/2019
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Présents
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- Véronique Vié
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- Guillaume Raffy
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Compte-rendu
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plan
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1. ouvrir les images
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2. adapter les prétraitements de Marie-Françoise matlab en jython
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3. mesure de la diminution des globules au cours du temps
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3.1 suppression des pièges (masques + tracking)
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3.2 detection des particules : 1 cinétique par particule
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- idée pour la séparation des particules : suivi de contour et detection de portions circulaires pour en déduire les particules en supposoant que'elles sont sphériques.
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4. présenter les résultats
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4.1 tableau 7 colonnes
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- numéro de particule
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- temps
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- sphéricité
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- rayon
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- position centre
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- estimateWhiteFluoImageTelemos
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- entrée : S: 1 sequence fluo
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- sortie : E: 1 image de white fluo estimée
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- findWhiteReferenceImageTelemos : trouve le meilleur z dans un stack de white (matériau fluorescent : lame de Matthieu)
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- entree :
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- E : 1 image de white fluo estimée
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- W : 1 stack de white (référence)
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- darkImage
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-sortie
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- R : 1 image de white de reference après soustraction du Dark
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