lipase/doc/notes/2022-01-26-meeting.md

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réunion zoom du 26/01/2022

date: 26/01/2022 de 09:30 à 12:30 par zoom

présents:

  • véronique vié
  • claire bourlieu
  • guillaume raffy

discussions

cbourlieu a rappelé les différentes campagnes d'acquisition

  • campagne 1: 2016
    • pas de white ni de dark
  • campagne 2: 2017
    • une seule positon : 80 images sur 40 min
  • campagne 3: 2018
    • 2 à 3 positions :
  1. estimer le white sur la fluo à 327 sur la campagne de 2016 slide 14 - gghl_rdgl_sgf_ph55_pre slide 18 - gghl_rdgl_sgf55_lambda 1a. d'abord voir si estimateWhite fonctionne 1b. si estimatewhite ne fonctionne pas bien, méthode plus simple : estimer le white par une carte des minimum local (attention slide slide 28 gghl_sdf_nadtc)

1 en phase gastrique : slide 14 1 en phase intestinale : slide

attention : on n'a pas de dark pour 2016

-> s'assurer que l'ensemble du prétraitement fournit une image uniforme

  1. proposition de graffy : outil de profil radial
  • à partir de'un cercle :
  • profil périmétrique
  • profil radial

actions

  1. cbourlieu va envoyer les 2 séries de 2016 prioritaires pour le traitement. graffy va s'assurer que le prétraitement fonctionne dessus même si on n'a pas de white ni de dark
  2. graffy va mettre en place la fonctionnalité de findWhiteReferenceImageTelemos pour trouver l'image