lipase/doc/notes/2019-07-09-meeting.md

Réunion d'avancement du 09/07/2019

Présents

• Véronique Vié
• Guillaume Raffy

Compte-rendu

plan

1. ouvrir les images
2. adapter les prétraitements de Marie-Françoise matlab en jython
3. mesure de la diminution des globules au cours du temps
   1. suppression des pièges (masques + tracking)
   2. detection des particules : 1 cinétique par particule
      • idée pour la séparation des particules : suivi de contour et detection de portions circulaires pour en déduire les particules en supposoant que'elles sont sphériques.
4. présenter les résultats
   1. tableau 7 colonnes
      • numéro de particule
      • temps
      • sphéricité
      • rayon
      • position centre

• estimateWhiteFluoImageTelemos
  • entrée : S: 1 sequence fluo
  • sortie : E: 1 image de white fluo estimée
• findWhiteReferenceImageTelemos : trouve le meilleur z dans un stack de white (matériau fluorescent : lame de Matthieu)
  • entree :
    • E : 1 image de white fluo estimée
    • W : 1 stack de white (référence)
    • darkImage -sortie
    • R : 1 image de white de reference après soustraction du Dark